MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p06

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018489	GTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018489	A	6	6	47	52	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018489	ATT	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018489	CTTTT	2	10	173	182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018489	ACA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018489	A	7	7	269	275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018489	TA	3	6	311	316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018489	GA	3	6	332	337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018489	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
10	NC_018489	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558810
11	NC_018489	AGA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
12	NC_018489	A	7	7	551	557	100 %	0 %	0 %	0 %	402558810
13	NC_018489	T	6	6	590	595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018489	AGG	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018489	AAT	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558811
16	NC_018489	A	6	6	648	653	100 %	0 %	0 %	0 %	402558811
17	NC_018489	AG	3	6	662	667	50 %	0 %	50 %	0 %	402558811
18	NC_018489	T	7	7	672	678	0 %	100 %	0 %	0 %	402558811
19	NC_018489	TGAA	2	8	694	701	50 %	25 %	25 %	0 %	402558811
20	NC_018489	GAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558811
21	NC_018489	GT	3	6	776	781	0 %	50 %	50 %	0 %	402558811
22	NC_018489	ACT	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018489	GA	3	6	962	967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018489	CAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018489	T	7	7	1066	1072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018489	TAG	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018489	TAT	2	6	1220	1225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018489	AAT	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018489	ACT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558812
30	NC_018489	ATG	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558812
31	NC_018489	GAG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558812
32	NC_018489	A	6	6	1555	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	402558812
33	NC_018489	AGA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
34	NC_018489	TA	3	6	1693	1698	50 %	50 %	0 %	0 %	402558812
35	NC_018489	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
36	NC_018489	GTCCA	2	10	1755	1764	20 %	20 %	20 %	40 %	402558812
37	NC_018489	TAA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558812
38	NC_018489	TAAT	2	8	1804	1811	50 %	50 %	0 %	0 %	402558812
39	NC_018489	AT	3	6	1818	1823	50 %	50 %	0 %	0 %	402558812
40	NC_018489	TTTC	2	8	1830	1837	0 %	75 %	0 %	25 %	402558812
41	NC_018489	AGA	2	6	1862	1867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
42	NC_018489	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558812
43	NC_018489	CAAT	2	8	2066	2073	50 %	25 %	0 %	25 %	402558812
44	NC_018489	AAG	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
45	NC_018489	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558812
46	NC_018489	A	6	6	2253	2258	100 %	0 %	0 %	0 %	402558812
47	NC_018489	AGAC	2	8	2293	2300	50 %	0 %	25 %	25 %	402558812
48	NC_018489	TTA	2	6	2326	2331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558812
49	NC_018489	GAAATG	2	12	2388	2399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018489	TA	3	6	2440	2445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018489	TCC	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018489	GAGT	2	8	2492	2499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018489	A	6	6	2604	2609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018489	TTA	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018489	ATA	2	6	2812	2817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018489	GTTCC	2	10	2901	2910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018489	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018489	GAT	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018489	GCG	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018489	TA	3	6	3220	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018489	ATC	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018489	TA	3	6	3298	3303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018489	TAG	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018489	GTC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018489	A	7	7	3527	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018489	ATTA	2	8	3556	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018489	TAG	2	6	3567	3572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018489	ATT	2	6	3587	3592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018489	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018489	TGT	2	6	3700	3705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018489	GAA	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558813
72	NC_018489	GAAA	2	8	3785	3792	75 %	0 %	25 %	0 %	402558813
73	NC_018489	GGAA	2	8	3846	3853	50 %	0 %	50 %	0 %	402558813
74	NC_018489	ACA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
75	NC_018489	CTA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558813
76	NC_018489	A	7	7	3954	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	402558813
77	NC_018489	A	6	6	3983	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	402558813
78	NC_018489	AT	3	6	3996	4001	50 %	50 %	0 %	0 %	402558813
79	NC_018489	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558813
80	NC_018489	T	7	7	4028	4034	0 %	100 %	0 %	0 %	402558813
81	NC_018489	A	6	6	4039	4044	100 %	0 %	0 %	0 %	402558813
82	NC_018489	ACA	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
83	NC_018489	TGT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558813
84	NC_018489	TAA	2	6	4084	4089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558813
85	NC_018489	ATAA	2	8	4127	4134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018489	GGA	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018489	TCT	2	6	4200	4205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
88	NC_018489	TAG	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558814
89	NC_018489	CAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
90	NC_018489	TTG	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558814
91	NC_018489	A	6	6	4529	4534	100 %	0 %	0 %	0 %	402558814
92	NC_018489	GT	3	6	4546	4551	0 %	50 %	50 %	0 %	402558814
93	NC_018489	ATA	2	6	4558	4563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558814
94	NC_018489	TATC	2	8	4627	4634	25 %	50 %	0 %	25 %	402558814
95	NC_018489	ATGA	2	8	4638	4645	50 %	25 %	25 %	0 %	402558814
96	NC_018489	TAT	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
97	NC_018489	AGG	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558814
98	NC_018489	AAC	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
99	NC_018489	ATCG	2	8	4752	4759	25 %	25 %	25 %	25 %	402558814
100	NC_018489	TACAG	2	10	4767	4776	40 %	20 %	20 %	20 %	402558814
101	NC_018489	TTA	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
102	NC_018489	GTC	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558814
103	NC_018489	TTA	2	6	4867	4872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
104	NC_018489	CTT	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
105	NC_018489	ACT	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558814
106	NC_018489	A	6	6	5009	5014	100 %	0 %	0 %	0 %	402558814
107	NC_018489	CTGG	2	8	5236	5243	0 %	25 %	50 %	25 %	402558815
108	NC_018489	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
109	NC_018489	TCT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
110	NC_018489	TTA	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
111	NC_018489	CAA	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
112	NC_018489	AAT	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
113	NC_018489	TTC	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
114	NC_018489	TATG	2	8	5528	5535	25 %	50 %	25 %	0 %	402558815
115	NC_018489	AAGCA	2	10	5557	5566	60 %	0 %	20 %	20 %	402558815
116	NC_018489	GTATA	2	10	5585	5594	40 %	40 %	20 %	0 %	402558815
117	NC_018489	A	6	6	5752	5757	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
118	NC_018489	ATG	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
119	NC_018489	CAAA	2	8	5961	5968	75 %	0 %	0 %	25 %	402558815
120	NC_018489	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
121	NC_018489	AGCA	2	8	5995	6002	50 %	0 %	25 %	25 %	402558815
122	NC_018489	A	6	6	6009	6014	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
123	NC_018489	TTA	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
124	NC_018489	GAA	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
125	NC_018489	AAC	2	6	6151	6156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
126	NC_018489	TTA	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
127	NC_018489	CGA	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558815
128	NC_018489	TGAAT	2	10	6305	6314	40 %	40 %	20 %	0 %	402558815
129	NC_018489	ATG	3	9	6388	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
130	NC_018489	TAT	2	6	6417	6422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
131	NC_018489	CAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
132	NC_018489	TGA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
133	NC_018489	ATG	2	6	6526	6531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
134	NC_018489	TA	3	6	6591	6596	50 %	50 %	0 %	0 %	402558815
135	NC_018489	A	6	6	6641	6646	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
136	NC_018489	AGA	2	6	6719	6724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
137	NC_018489	CTT	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
138	NC_018489	CAAT	2	8	6842	6849	50 %	25 %	0 %	25 %	402558815
139	NC_018489	ATG	3	9	6988	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
140	NC_018489	ATC	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
141	NC_018489	CTT	3	9	7075	7083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
142	NC_018489	TAC	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
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275	NC_018489	GATAT	2	10	13501	13510	40 %	40 %	20 %	0 %	402558823
276	NC_018489	AGA	2	6	13513	13518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558823
277	NC_018489	GA	3	6	13517	13522	50 %	0 %	50 %	0 %	402558823
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279	NC_018489	AGA	2	6	13659	13664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558823
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281	NC_018489	AG	3	6	13723	13728	50 %	0 %	50 %	0 %	402558823
282	NC_018489	AGA	2	6	13810	13815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_018489	ATA	2	6	13897	13902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018489	TAA	2	6	13960	13965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018489	TAT	2	6	13967	13972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018489	A	6	6	14026	14031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.